ООП, как объектно-ориентированное программирование, оперирует с целостными объектами. Не нарушают ли частичные классы эту целостность?
Если вы говорите о технологии WPF или Win Forms, где частичные классы сгенерированы средой, то само собой ничего использование частичных классов не нарушает.
Вообще Partial классы были введены для удобства, что б можно было отделять разную логику в классе, так что ничего плохого в них вообще нет. Partial класс - это не раздробленный объект, это просто способ написания класса и его дополнение определённой логикой в разных местах